企业报送的税控发票存根联明细数据软盘和税控 IC卡经主管税务局核对后，两者不一致的，应区别不同情况作如下处理:
1、因企业硬盘损坏等原因造成软盘中税控发票存根联份数小于税控 IC 卡中份数的，企业应提供当月全部税控发票存根联，到主管税务所通过认证子系统进行扫描补录。
2、因企业更换金税卡等原因造成软盘中税控发票存根联份数大于税控 IC卡(不含税控 IC卡为零的情况)中份数的，其软盘中所含税控发票存根联明细数据可读入报税子系统,但当月必须查明产生此种不一致情况的原因。
3、因企业计算机型号不匹配造成税控 IC卡中税控发票存根联数据为零的，根据系统提示可以存入的，将软盘数据存入报税系统;根据系统提示不能存入的,企业应持当月全部税控发票存根联到主管税务所通过认证子系统进行扫描补录。
4、因企业软盘质量问题致使无法采集税控发票存根联数据的企业应重新报送软盘。
抄税流程
抄税是指开票单位将防伪税控中开具的增值税发票的信息读入企业开发票使用的 IC卡中，然后将IC卡带到国税局去，读到他们的电脑系统中.
以便和取得发票的企业认证进项税金，记入国税局计算机系统的信息进行全国范围的发票比对，防止企业开具阴阳票、大头小尾票并控制企业的销售收入。
抄报税操作
应该是报税、抄税、认证，是增值税防伪税控系统每个月必须做的工作，是金税工程所属的开票、认证两个系统的工作，按照具体的操作顺序:
1、抄税:
用户抄报税流程-
抄税写 IC卡--打印各种报表-→报税
A、抄税起始日正常抄税处理;
进入系统-→报税处理-一抄报税管理-一抄税处理-→系统弹出"确认对话框"-→插入IC卡，确认-→正常抄写 IC卡成功
B、重复抄上月旧税:
进入系统-→报税处理-→抄报税管理-→抄税处理-→系统弹出"确认对话框”-→插入IC卡，确认-→抄上月旧税成功
C.金税卡状态查询
进入系统-→报税处理-→金税卡管理-→金税卡状态查询-一系统弹出详细的信息
2、报税:将抄税后的 IC卡和打印的各种销项报表到税务局纳税服务大厅交给受理报税的税务工作人员，他们会根据报税系统的要求给你报税，也就是读取你 IC卡上开票信息，然后与各种销项报表相核对，然后进行报税处理。
3、认证: 认证时携带当月要准备抵扣的增值税发票抵扣联,到国税局发票认证窗口办理即可，增值税专用发票开出 90天内认证有效当月认证的必须在当月抵扣非正常抄税的处理指
一般纳税人开票系统及抄报税常见故障
适用范围 更换金税卡、重新发行金税卡和丢失或被盗金税
卡或 IC 卡等情况
受理资料:
1、IC 卡
2、手工制作的《增值税专用发票汇总表》(盖公章)
3、手工制作的《增值税普通发票汇总表》(盖公章)
4、当月已开具尚未抄税的所有专用发票(包括正常票和作废票)
5、上次抄税的最后一张专用发票
6、全部空白专用发票
7、发票领购簿和发票发售清单
8、科税公司的维修单(更换金税卡或重新发行金税卡时用，须经税政科签名)
9、丢失、被盗防伪税控系统专用设备情况表(丢失或被盗金税卡或 IC卡时用)
三、办理程序:
1、防伪税控企业在服务单位(科税公司)取得新金税卡
2、防伪税控企业当月存在有开出的增值税专用发票和增值税普通发票时，办税服务厅填写《非正常报税处理表》，采用存根联补录方式扫描采集当月所有的已开出的增值税专用发票和增值税普通发票
3、防伪税控企业到税政科发行金税卡
4、防伪税控企业带上经税政科发行金税卡并签名的科税公司维修单(第一联)到办税服务厅录入空白发票
四、相关 WINDOWS开票系统手工表格可以在本公司网站的"最新通知]windows 开票系统相关手工报表格式"下载。税务会计的报税程序(一般纳税人)
增值税一般纳税人开票系统是"金税工程"中的一个子系统，也是一个与抄报税等操作环节密切相关的税收控管软件。一些企业在日常的开票及抄报税过程中，由于某些环节未操作到位或其它原因，系统时常就会出现一些"故障"，而影响企业日常的开票或抄报税工作。
来源：金锄头文学
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